北京儿童医院精神科目前已开设如下专业细分门诊：注意缺陷多动门诊、孤独多动抽动门诊、学习困难门诊、心理咨询门诊、青春期心理咨询门诊、精神病专病门诊、精神残疾评估门诊、脑功能及行为发育门诊、脑认知功能评估门诊、心身会诊联络门诊等。
北京儿童医院精神科以追求学科学术水平不断提高为主要目标，提升学科的核心竞争力。加强研究生教育，持之以恒打造教学方式蕞先进、专业设置蕞齐全的儿童精神医学高级医学人才培养平台。力争在儿童精神医学领域的综合实力达到国内领 先、国际一 流的地位。
北京儿童医院精神科主任医师陆小彦，主要从事儿内科及感染性疾病的临床和教学工作，历任总住院医师，主治医师，副主任医师，住院病区主任等。1999年在北京大学第六医院专修儿童心理及精神专科，掌握儿童精神疾病的诊断和原则，同年创办儿童医院心理门诊;2001年在中国科学院心理所医学心理咨询与专业学习，并于2003年研究生班毕业、获心理测量及心理从业资格证书;2004年与首都医科大学合作，引进CES(微量生物电径颅磁刺激)技术儿童各种疼痛、紧张、焦虑、等症状并取得良好效果。
北京儿童医院以病人为中心，全心全意为儿童服务，大力弘扬“公慈勤和”院训精神，涌现出全国道德模范、全国共产党员贾立群同志等杰出代表。医院坚持公益，始终“关注儿童、关注健康”，成立“北京儿童健康基金会”，扶助困难家庭患儿就医;组织医疗骨干参加援疆援藏任务、“人才京郊行”、大型义诊活动，为偏远地区和基层单位的儿童送医、送药、送健康;开展免费救治西藏先心病、唇腭裂患儿活动，举办血友病、糖尿病、白血病儿童夏令营，让患儿感受到社会的温暖。